H Μαίρη Ζυγούρη ασχολείται με θέματα σχετικά με την ατομική, πολιτική και κοινωνική κρίση ταυτότητας στο σύγχρονο κόσμο. Έχοντας μια άκρως μεταφεμινιστική θεώρηση έμφυλων σχέσεων εξουσίας, εστιάζει στην αμφίδρομη σχέση με την εξουσία, τη λογοκρισία, την επιτήρηση του ελέγχου και τις συνθήκες εξαναγκασμού και υποτέλειας. Ξεκινά από ιστορικά γεγονότα, ερευνά αρχεία, βιογραφίες και διηγηματικές αφηγήσεις, στοιχεία του παρελθόντος τα οποια τα συναρμολογεί σε μια μεγαλύτερη αφήγηση, μεταφέροντας, επαναπροσδιορίζοντας και παρουσιάζοντάς τα στη σύγχρονη πια πραγματικότητα. Κοινός άξονας της καλλιτεχνικής πρακτικής της, είναι ο παρεμβατικός και “παραβατικός” χαρακτήρας των δρασεών της σε δημόσιους χώρους. Ο τόπος δράσης που κάθε φορά επιλέγει ή προκύπτει, λειτουργεί ως όριο και άξονας της (site specific) παρέμβασης. Οι παράλογες και “πολιτικά ποιητικές” performances της, ως αυθεντικές εμπειρίες, όπου ο περιορισμένος έλεγχος ως προς την εξέλιξη της (η συμπεριφορά του κοινού που εμπλέκεται είναι μη προβλέψιμη), αποσκοπά στην ανίχνευση οριών σε σχέση με τις θεσμοθετιμένες και κοινωνικές δόμες. Ενεργοποιεί έτσι μια αυθεντική αντίδραση, προκαλεί το περαστικό κοινό να δράσει, να συμμετάσχει, παράγοντας νέες μορφές κοινωνικής συνεύρεσης, ανοίγοντας πεδία ανοιχτού, παραγωγικού και κριτικού λόγου. Κατά κύριο λόγο συνεργάζεται με εναλλακτικούς φορείς διεκδικώντας μιά αυτόνομη θέση έργου και καλλιτέχνη. Ακόμα και σε περιπτώσεις συνεργασίας με Θεσμικούς φορείς προσπαθεί να διατηρεί τον αυτόνομο χαρακτήρας της γλώσσας της.